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Sylvain Cussat-Blanc, "Presentation du projet Onko3D", colloque de l'IRIT

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le 7 novembre 2016
 12h30
Manufacture des Tabacs -  ME303

Sylvain Cussat-Blanc, maitre de conférences à l’Université Toulouse 1 Capitole, nous présentera le projet Onko3D hébergé depuis janvier 2016 à l’Institut des Technologies Avancées des sciences du Vivant (ITAV).

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 Abstract: Lors de ce séminaire, le projet Onko3D, nouvellement hébergé à l’ITAV, sera présenté. Ce projet a pour but de simuler la prolifération de cellules cancéreuses dans un environnement virtuel tridimensionnel. Grâce à un modèle de cycle cellulaire basé sur l’enchainement des checkpoints et non des phases, le comportement de tous types de cellules peut être simulé avec précision dans un environnement dynamique. Ce modèle a été validé sur 3 lignées cellulaires distinctes (HeLa, HCT116, U2OS) via un protocole expérimental mené parallèlement in-vitro et in-silico lors de la thèse de Jonathan Pascalie. Actuellement, un modèle de physique cellulaire inspiré de la théorie des poutres est en cours de développement afin de prendre en compte les interactions physiques entre les cellules (collision et adhésion). Ce modèle, proposé par Jean Disset, se présente comme un compromis entre la simplicité des modèles masses-ressorts-amortisseurs et la complexité des modèles à éléments finis. Enfin, les premières ébauches d’un modèle de diffusion de molécules dans les microtissus, actuellement en cours de développement par David Bernard, seront présentées. Le but de ce modèle est de simuler la diffusion de drogues dans les amas cellulaires, drogues qui modifieront le comportement cellulaire. Le but à long terme du projet Onko3D est de proposer un modèle complet de simulation de la prolifération cellulaire qui permettrait aux biologistes d’expérimenter in-silico avant de valider in-vitro et de rechercher automatique de traitements.

Faculté d'informatique

Mise à jour le 28 octobre 2016


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