Jonathan PASCALIE - IRIT - VORTEX

Modélisation du cycle cellulaire pour la simulation de culture in silico


Mots clés : Vie artificielle, simulation, biologie synthétique


Pour l'étude des systèmes complexes la simulation et les modèles virtuels présentent un grand intérêt. En biologie cellulaire notamment où les modèles issus de la vie artificielle peuvent permettre l'expérimentation de nouveaux concepts. Dans ce contexte il est important de proposer une modélisation générique des éléments de base de ces systèmes que sont la cellule et le cycle cellulaire. Le cycle cellulaire caractérise le comportement d'une cellule de sa naissance à sa division en deux cellules filles. L'étude de ses mécanismes de régulation est un des enjeux clés de la recherche contre le cancer, en effet des perturbations sur les mécanismes de contrôle entrainent généralement une prolifération invasive. In vitro cette étude peut se faire au travers d'un modèle de culture tridimensionnelle appelé sphéroïde. In silico des simulations sont effectuées au travers de modèles issus de la vie artificielle, des systèmes multi-agent et des mathématiques. Durant cette présentation je vous ferai part de mes travaux de début de thèse sur la modélisation du cycle cellulaire et de l'utilisation de mécanismes de vie artificielle pour l'étude et la simulation de cellules virtuelles ; ainsi que des perspectives autour de la construction d'un laboratoire virtuel permettant la modélisation générique de cellules et la création d'expérimentations in silico grace à des scénarii pré-définis.