Les composantes de l'université déterminent leurs statuts, qui sont approuvés par le Conseil d'administration de l'université, et leurs structures internes. Le Président associe les composantes de l'université à la préparation et à la mise en œuvre du contrat pluriannuel d'établissement. La création, la suppression ou le regroupement de composantes sont inscrits dans le contrat pluriannuel d'établissement, le cas échéant, par voie d'avenant.

L'Université Toulouse Capitole regroupe diverses composantes qui sont :
 

• Des unités de formation et de recherche, des départements, laboratoires et centres de recherche, créés par délibération du Conseil d'administration de l'université après avis du Conseil scientifique ;


• Des écoles ou des instituts, créés par arrêté du ministre chargé de l'Enseignement supérieur sur proposition ou après avis du Conseil d'administration de l'université et du Conseil national de l'Enseignement supérieur et de la Recherche.